Después del levantamiento geológico de la Cordillera de los Andes, hace 70 millones de años, se formó un inmenso y variado ecosistema: la cuenca Amazónica. Su corazón es el río más grande del mundo que le da a esta región su nombre, el Río Amazonas.
Al Ecuador le corresponde el 2% de la Amazonía , una parte muy significativa conocida como alta amazonía por su ubicación geográfica que corresponde a los flancos de la cordillera de los Andes y sus volcanes (Cayambe, Antisana, Cotopaxi y Sangay), es decir desde los 6.000 msnm hasta los 300 msnm en una distancia de 120 km siendo por los tanto una zona de alta biodiversidad. Al comienzo la vegetación es montañosa, cambia lentamente hacia una vegetación mixta de montaña y selva y termina con una vegetación netamente selvática.
Una variedad de ríos como el Cuyabeno se presenta en esta zona, éste se forma por las agua negras (sistema hidráulico que atraviesa tierras que se inundan una temporada del año). De este modo ha formado 14 lagunas de diferentes tamaños que son el hogar de una variedad de especies acuáticas y aves.
Existe además una variedad de culturas indígenas, muchas de ellas milenarias, entre las más importantes tenemos: Quichua, Siona-Secoya, Cofanes, Huaoranis.